Das Sternenflottenkommando der Erde – im Hintergrund die Golden Gate Bridge
Das Sternenflottenkommando in den 2350ern
Das Sternenflottenkommando ist das Hauptquartier der Sternenflotte.
Der Standort befindet sich in der Bucht von San Francisco auf dem Planeten Erde. Innerhalb des Sternenflottenkommandos gibt es den Sternenflottenstab, der alle wichtigen Entscheidungen berät und letztendlich fällt.
2151 trifft sich Captain Jonathan Archer, Kommandant der neuen USS ENTERPRISE / NX-01, mit Admiral Maxwell Forrest, Admiral Daniel Leonard, Commander Williams, sowie weiteren Menschen und Vulkaniern im Sternenflottenkommando. Dieses Treffen soll klären, was mit dem verletzten Klingonen namens Klaang passieren soll. Letztlich wird die ENTERPRISE damit beauftragt, den Klingonen zurück nach Qo'noS zu bringen.
2152 beordert das Sternenflottenkommando die ENTERPRISE zur Erde zurück, nachdem durch den Erstkontakt der ENTERPRISE, die Minenkolonie auf Paraagan II vollkommen zerstört worden ist. Der Kommandorat des Sternenflottenkommandos entscheidet jedoch später gegen die Empfehlung des Vulkanischen Oberkommandos, dass die ENTERPRISE' ihre Mission fortsetzen kann.
2153 nutzen Admiral Forrest und Commander Williams die Möglichkeiten des Sternenflottenkommandos, um eine plötzlich aufgetretene Krise mit aktivierten Borg-Drohnen, die von der abgestürzten Borg-Sphäre aus dem Jahr 2063 stammen, zu meistern.
Nachdem die Xindi einen verheerenden Überraschungsangriff auf die Erde durchgeführt haben beordert das Sternenflottenkommando die Enterprise erneut zurück. Captain Archer fasst nach mehreren Diskussionen den Schluss, mit seinem Schiff die Xindi zu suchen und die geheime Xindi-Superwaffe aufzuspüren und wenn nötig zu zerstören.
Als die ENTERPRISE im Jahr 2154 nach der erfolgreichen Zerstörung der Xindi-Waffe zurückkehrt muss sich Captain Archer einer ausführlichen Befragung im Sternenflottenkommando unterziehen. Zu den Vorsitzenden gehört auch der Vulkanier Soval an, der sehr an dem Schicksal der SELEYA interessiert ist. Das Sternenflottenkommando ist die höchste Kommandobehörde der Sternenflotte und wird geführt vom Oberbefehlshaber der Sternenflotte. Dieser untersteht dem Chef des Stabes beim Minister für Erforschung und Verteidigung.
Nur der Präsident der Föderation und der Föderationsrat sind weisungsbefugt.
Dem Befehlshaber sind alle stationären und fliegenden Verbände der Sternenflotte unterstellt. In Kriegszeiten wie dem Dominion-Krieg sind die Schiffe der Sternenflotte in Flotten zusammengefasst. Diese besitzen auch einen Teil von Schiffen anderer Völker z.B. die der Klingonen. General Martok von der Klingonische Verteidigungsstreitmacht wurde sogar auf Wunsch von Captain Sisko zum Kommandanten der 9. Flotte befördert.
Das Kommando, der so genannte Admiralstab, setzt sich zusammen aus den Chefs, meist Admirale, der Abteilungen beziehungsweise der Bereiche. Diese sind im Einzelnen: Sicherheitsdienst, Medizinisches Corps, Geheimdienst.
Der Befehlshaber der Sternenflotte ist ein Admiral im Rang eines Fleetadmirals. Das Kommando hat seinen Sitz in San Francisco auf der Erde.
2375 greifen die Breen im Zuge ihrer Dominion-Breen-Allianz mit dem Dominion überraschend das Hauptquartier der Sternenflotte in San Francisco an und beschädigen sowohl die Einrichtung, als auch die Golden Gate Bridge.